CFIやRMSEAは自由度によっては１，０になります。飽和モデルでないのに１や０になっているのは当てはまりがいいという解釈で（一応は）問題ないと思います。なので特に解決する必要はないです。言うまでもないことですが、適合度指標だけでモデルの良さを評価するのは難しいので、その点だけ注意してください。