プレイできるニンジャやゲームの幅が広がりました。初版は原作第1部を再現するように作られ、プレイヤーは基本邪悪なサンシタソウカイニンジャです。2版では3部作+AoMの一部要素がミックスされ、邪悪ではないニンジャや別組織のニンジャでの続き物ゲームもプレイしやすくなっています。