まず時代が違う。勘合貿易は室町、朱印船貿易は江戸時代です。 勘合貿易は明（中国）で海賊の倭寇と正式な貿易船とを区別するために勘合（合い札）を使いました。 朱印船貿易は江戸幕府からの許可証（朱印状）をもらった船が東南アジアなどと貿易を行いました。